黄瓜矮生基因(cp)连锁的简单重复序列(SSRs)和序列标签位点(STS)标记

• 作者: 孟永娇 李玉红 程智慧 钟艳花 陈鹏 雍建朋
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 黄瓜 矮生基因(cp) 精细定位 微卫星标记 序列标签位点
• 年，卷（期）: 2013,（10）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1152-1158
• 页数: 7页
• 字数: 4763字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2013.10.003

摘要

矮化株型是黄瓜(Cucumis sativus L.)重要的农艺性状,对于实现黄瓜的密植高效栽培和机械采收具有潜在的应用价值.矮生基因(compact gene,cp)控制着黄瓜的矮生性状,初始精细定位已经将cp基因定位在220kb的区间,且与细胞分裂素氧化酶基因(CKX)共分离.为了进一步缩短cp基因的定位区间,本研究在原有研究基础上,以黄瓜蔓生材料WI7200(长节间)与矮生材料WI7201(短节间)为亲本,即与cp初始精细定位的F2群体(1 273株)的相同亲本,新构建了一个较大的F2群体,利用cp初始精细定位的两侧翼微卫星标记UW084680和UW084870筛选以相同亲本新构建的F2群体中的1 348个单株,共筛选出57株重组交换单株;在cp基因初始精细定位的220 kb区间内,利用黄瓜基因组测序结果及生物信息学分析,在标记区域内新开发了68对微卫星标记和1对序列标签位点(STS)标记,2对简单重复序列(SSR)标记和1对STS标记被成功用于交换单株的分析,并结合cp基因初始精细定位所用F2群体的1 273株单株的数据,最终利用2 621F2单株将cp基因定位在178 kb的区间内,其共分离标记是SSR标记UW057998和STS标记cp-STS-6.最近的两侧翼标记CKX-indel和UW058058与cp基因分别相距0.04和0.23 cM,此结果排除了CKX作为cp候选基因的可能性,因此矮生基因的候选基因定位在标记CKX-indel和UW058058的178 kb区间,本研究结果不仅为进一步筛选和确认cp基因提供了基础数据,也为黄瓜矮生性状的分子标记辅助育种提供了科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	程智慧	西北农林科技大学园艺学院	274	4372	33.0	51.0
2	李玉红	西北农林科技大学园艺学院	44	605	14.0	23.0
3	陈鹏	西北农林科技大学生命学院	65	668	14.0	23.0
4	雍建朋	西北农林科技大学园艺学院	2	5	1.0	2.0
5	孟永娇	西北农林科技大学园艺学院	1	5	1.0	1.0
6	钟艳花	西北农林科技大学园艺学院	1	5	1.0	1.0