2011年河南省脑炎患者柯萨奇病毒B5型分离株基因组序列分析

• 作者: 康锴 潘静静 茹维萍 许汴利 谢志强 陈豪敏 马红霞 黄学勇
• 来源期刊: 中华流行病学杂志
• 关键词: 柯萨奇病毒B5型 脑炎 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2013,（12）
• 所属期刊栏目: 实验室研究
• 页码范围: 1213-1215
• 页数: 3页
• 字数: 2243字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2013.012.013

摘要

目的 分析河南省柯萨奇病毒B5(CVB5)分离株全基因序列,了解其遗传特性.方法 采集2例脑炎患者临床标本,分离病毒,提取病毒阳性分离物RNA,进行RT-PCR扩增,产物直接测序.利用DNAStar 5.01和Mega 5.05软件进行全基因序列拼接及亲缘进化分析.结果 获得2株CVB5分离株(03001N和17Y)全基因组序列,核苷酸长度分别为7408 bp和7404 bp,两者核苷酸同源性为97％,同2010年河南CVB5分离株同源性最高,分别为98％和99％.5'-UTR分别为747 bp和743 bp;3’-UTR区均为103bp;病毒基因组编码区全长同为6558 bp,编码含2185个氨基酸残基的多聚蛋白,氨基酸同源性为99％.VP1区系统发生树分析显示,2株CVB5分离株进化关系较近,同近年来国内其他分离株成一簇,而2009年的河南省CVB5分离株同山东省CVB5分离株成一簇.结论 河南省内存在不同CVB5株传播链的流行,此次分离株为近几年内的主要流行株.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许汴利		148	1187	16.0	24.0
2	康锴		65	786	15.0	23.0
3	马红霞		17	76	5.0	8.0
4	陈豪敏		58	514	12.0	18.0
5	黄学勇		93	505	10.0	17.0
6	潘静静		23	258	9.0	15.0
7	谢志强		16	132	7.0	11.0
8	茹维萍		3	27	3.0	3.0