黄瓜基因组中抗霜霉病候选基因的生物信息学其表达特异性

• 作者: 刘大军 周秀艳 武涛 秦智伟 辛明
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 黄瓜 抗霜霉病基因 RT-PCR 表达分析
• 年，卷（期）: 2013,（19）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 4066-4074
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.19.012

摘要

[目的]寻找黄瓜抗霜霉病基因,研究黄瓜抗霜霉病机制.[方法]利用拟南芥和甜瓜抗霜霉病蛋白质序列,搜索黄瓜基因组数据库;通过生物信息学分析候选基因特征,以黄瓜抗霜霉病自交系M801-3-1为试材,分析候选基因在叶片组织中的表达状态.[结果]共获得187个黄瓜抗霜霉病候选基因;确定了候选基因染色体位置和排列特点、序列相似性特征以及系统进化关系;大部分黄瓜R基因在未接种霜霉病菌的抗病自交系和感病叶片组织中都有一定的表达量,在接种霜霉病菌后在抗病自交系M801-3-1中Csa001907和Csa002921表达量下调,感病自交系M302-3中Csa001907和Csa002921变化不明显.[结论]在黄瓜基因组中存在185个与拟南芥抗霜霉病基因同源的R基因,2个与甜瓜的抗霜霉病基因At1和At2同源的eR基因,通过聚类分析这些基因可以分为6类,初步认定Csa001907和Csa002921为黄瓜抗霜霉病的R基因,这2个基因在叶片组织中有一定表达量,其表达量减少可诱发抗病黄瓜品种的抗病反应.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周秀艳	东北农业大学园艺学院	111	1188	17.0	28.0
2	秦智伟	东北农业大学园艺学院	170	2065	23.0	34.0
3	刘大军	东北农业大学园艺学院	23	78	5.0	7.0
5	武涛	东北农业大学园艺学院	28	274	9.0	16.0
6	辛明	东北农业大学园艺学院	37	234	6.0	14.0