甘蔗SCL25基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 刘娟 刘少谋 吴嘉云 廖振阳 李虎 林彦铨 符成 邓祖湖 黄忠兴
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 甘蔗 ScSCL25基因 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 51-57
• 语种: 中文

摘要

结合电子克隆及RT-PCR获得了甘蔗(Saccharum spp.)花穗中表达的一个SR基因成员.该基因cDNA全长960 bp,包含编码209个氨基酸的开放读码框,gDNA序列长2 966 bp,包含5个内含子.同源性比对表明ScSCL25属于SCL亚家族,命名为ScSCL25(gb:JQ031566).应用生物信息学工具分析表明:ScSCL25编码蛋白为不稳定亲水性蛋白,含有33个潜在磷酸化位点;无信号肽无跨膜结构域,亚细胞定位于细胞核.该蛋白合有SR基因典型的RRM结构域和SR富集结构域,与玉米等作物的SR蛋白具有较高的同源性.