苹果属S-RNase基因的进化研究

• 作者: 周志钦 唐亮 李明霞 马香
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 苹果属 S-RNase基因 进化历史 序列分歧 遗传多态性
• 年，卷（期）: 2013,（13）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 2717-2729
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.13.010

摘要

[目的]通过分析苹果属植物自交不亲合性位点S-RNase基因的序列,研究S-RNase基因在苹果属的进化历史,序列分歧特点和遗传多态性.[方法]利用栽培苹果的S-RNase基因序列在GenBank数据库中检索和鉴定所有已知的苹果属植物的S-RNase基因,同时利用S-RNase基因的保守引物获得陇东海棠和变叶海棠的S-RNase基因序列.通过系统发育分析研究S-RNase基因的进化历史,进而计算dN/dS比值揭示S-RNase基因序列分歧的特点,最后估计并比较苹果属不同类群S-RNase基因的遗传多态性及其遗传分化.[结果]苹果属植物的S-RNase基因可以分为16个亚类,同一亚类S-RNase基因的序列分歧较小,亚类之间的分歧很大.S-RNase基因的成对dN/dS比值中有50％的大于1,并且滑动窗分析显示S-RNase基因具有多个dN/dS比值显著大于1的区域.栽培苹果和野生苹果在S-RNase基因的遗传多态性上没有明显差异.在所涉及的苹果属野生类群中,栽培苹果与塞威士苹果在S-RNase基因上的遗传分化最小.[结论]适应性氨基酸替换在苹果属植物S-RNase基因的序列分歧上发挥了重要作用.现有的S-RNase基因数据显示栽培驯化没有导致栽培苹果S-RNase基因遗传多态性的降低,基于S-RNase基因的遗传分化支持栽培苹果是由塞威士苹果驯化而来的观点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐亮	西南大学南方山地园艺学教育部重点实验室	6	57	4.0	6.0
5	周志钦	西南大学南方山地园艺学教育部重点实验室	54	629	15.0	23.0
9	马香	西南大学南方山地园艺学教育部重点实验室	6	15	2.0	3.0
13	李明霞	西南大学园艺园林学院	6	45	4.0	6.0