凡纳滨对虾3个sHSP成员的序列与表达特征分析

• 作者: 彭金霞 李咏梅 殷勤 蒋伟明 赵永贞 陈晓汉 陈秀荔 韦嫔媛
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 凡纳滨对虾 EST库 低温胁迫
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕
• 页码范围: 2127-2132
• 页数: 6页
• 分类号: S945.4+6
• 字数: 3997字
• 语种: 中文

摘要

通过搜索凡纳滨对虾EST数据库,获得3个包含完整开放阅读框的sHSP cDNA序列.对3个sHSP cDNA和相应蛋白序列进行多序列比对发现,3个sHSP的cDNA序列同源性非常高,均达到95％以上,但在开放阅读框第376 bp之后,3个基因间有多个插入和缺失突变,使编码的蛋白序列在C端有较大差异,sHSP-1与sHSP-2、sHSP-3蛋白的同源性只有86.5％和78.7％.不同物种多个sHSP蛋白序列构建的系统进化树显示,3个sHSP与其他物种的HSP20.6、HSP21.4和HSP Beta亲缘关系都很近,推测不同物种sHSP起源相似,且同一物种的不同sHSP通过基因复制产生.运用荧光定量PCR分析了sHSP-1和sHSP-2基因在凡纳滨对虾不同组织及低温胁迫处理下的表达,结果显示,sHSP-1和sHSP-2均在肌肉组织中优势表达,并在低温诱导对虾肌肉组织中呈上调表达,暗示sHSP基因可能在对虾应对低温时发挥功能.