小麦过敏原Tri a Bd 27k蛋白抗原表位预测及三维结构模拟

• 作者: 何颖 刘雪婷 夏宏林 翟锦明 邹泽红 陈惠芳
• 来源期刊: 现代预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 小麦过敏原 Tri a Bd 27k 抗原表位 三维结构
• 年，卷（期）: 2013,（15）
• 所属期刊栏目: 实验技术及其应用
• 页码范围: 2867-2871
• 分类号: R392.1
• 语种: 中文

摘要

目的 通过生物信息学方法了解小麦过敏原Tri a Bd 27k的结构特征,为小麦变态反应性疾病的诊断和预防提供依据.方法 在Uniprot数据库中获得Tri a Bd 27k蛋白序列,通过DNAStar预测B细胞抗原表位,NetMHCⅡ和Syfpeithi预测T细胞抗原表位;使用Swiss-Model软件预测其三维结构并用Ramachandran进行稳定性评估.在Uniport 数据库搜索Tria Bd 27k的同源蛋白,应用Clustalx 1.83及Mega 3.1构建同源进化树.结果 小麦过敏原Tri a Bd 27k的B/T细胞共同抗原表位优势区域为34-42、102-117,Ramachandran软件预测结果显示小麦Tri a Bd 27k蛋白的空间构象稳定.结论 通过对小麦过敏原Tria Bd 27k进行生物信息学分析获得了该过敏原优势区域及三维结构模型,为进一步了解和掌握小麦过敏原Tri a Bd 27k的结构功能打下理论基础.