贵州省2009～2011年度新型H1N1流感病毒HA1基因序列分析

• 作者: 付琳 任丽娟 庄丽
• 来源期刊: 现代预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 贵州省 新型H1N1流感病毒 HA1基因片段
• 年，卷（期）: 2013,（17）
• 所属期刊栏目: 实验技术及其应用
• 页码范围: 3256-3258
• 分类号: R373.1
• 语种: 中文

摘要

目的 建立并完善贵州省新型甲型H1N1流感病毒基因分析检测技术平台,了解2009～2010年度贵州省新型H1N1流感病毒HA1片段与WHO公布的流行株是否有发生变异.方法 收集10株新型H1N1流感病毒毒株,提取病毒核酸RNA,通过RT-PCR扩增HA1片断,用电泳观察PCR产物目的条带的大小,经过纯化、测序,用Biodeit、MEGA4相关软件进行序列比对,同源性及差异性分析,构建系统发育树.结果 与古典猪流感病毒株相比,贵州省2009年、2010年、2011年流感病毒株同源性分别为72.0％～74.6％、72.0％、67.8％～68.3％.与其他4株亚洲株H1N1流感病毒代表株相比,贵州省2009年、2010年、2011年流感病毒株同源性分别为92.3％～95.8％、91.5％～92.4％、89.8％～90.8％.2009年度组内同源性为93.2％～100％; 2010年组内高度同源,为100％; 2011年组内同源性为98.3％.贵州省流感毒株与中俄代表株A/Habarovak/01/2009 (H1N1)的HA1基因同属一个谱系,在同一个分支上,同时,与墨西哥第一株甲型H1N1流感A/Mexio City/001/2009 (H1N1)亲缘关系也较近,在同一个大分支上.结论 贵州省新型H1N1流感病毒代表株HA1基因与WHO公布的流行株在核苷酸水平有一定持续水平的变异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	庄丽		31	141	6.0	11.0
2	任丽娟		16	31	3.0	5.0
3	付琳		17	45	5.0	6.0