百日草几丁质酶基因片段克隆及其序列分析

• 作者: 张佳诗 张振鲁 李启云 杜茜 汪洋洲 王金刚 盛岩 隋丽
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 百日草 几丁质酶基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2013,（25）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 10256-10258,10398
• 页数: 4页
• 分类号: S681.9
• 字数: 2715字
• 语种: 中文

摘要

[目的]克隆百日草几丁质酶的基因片段,并对其序列进行分析.[方法]以百日草“梦境”系列为材料,提取其叶片总RNA,并根据其他植物几丁质酶基因保守序列设计简并引物,通过RT-PCR克隆百日草几丁质酶基因片段(ZEchi),并对该基因序列进行分析.[结果]克隆得到的片段长度为227 bp,共编码75个氨基酸残基;核苷酸同源性分析表明,ZEchi与已报道的其他植物几丁质酶基因同源性达70％以上,其中与葡萄的同源性最高,为74％;氨基酸同源性分析表明,该几丁质酶多肽属于18家族几丁质酶,且与已报道的其他植物几丁质酶氨基酸序列具有70％以上的相似性;氨基酸聚类分析表明,该几丁质酶多肽与白车轴草和蒺藜苜蓿的几丁质酶聚类;生物信息学分析表明,由该基因片段编码的多肽为非跨膜蛋白,主要含α螺旋和随机线圈螺旋等二级结构.[结论]该研究为进一步研究几丁质酶基因的功能奠定了基础.