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摘要:
利用BlastX将角毛壳菌(Chaetomium cupreum)几丁质诱导的菌丝体cDNA文库中的ESTs序列与NCBI的Nr(Non-redundant)数据库进行相似性搜索,获得泛素结合酶(ubiquitin conjugating enzyme,E2)基因的ESTs.以此结果设计引物进行RT-PCR,克隆该基因的cDNA序列(CcE2).该序列长600 bp,开放阅读框444 bp,编码147个氨基酸组成的多肽,蛋白分子量为16.6 ku,是亲水性蛋白.BlastP分析表明该基因进化相当保守,与其他真菌的E2具有高度的相似性;三维结构分析显示CeE2仅包含一个功能结构域,在结构域的中央是决定CcE2活性的半胱氨酸残基活性位点.
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来源于角毛壳茵的木聚糖酶xyn24基因克隆及特性
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关键词云
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文献信息
篇名 角毛壳菌泛素结合酶基因的克隆和特性分析
来源期刊 河南大学学报(自然科学版) 学科 生物学
关键词 泛素结合酶(E2) 角毛壳菌 克隆 生物信息学分析
年,卷(期) 2014,(1) 所属期刊栏目 生命科学
研究方向 页码范围 74-78
页数 5页 分类号 Q785
字数 3069字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 尚富德 河南大学生命科学学院 67 1197 19.0 31.0
2 贺洁 河南大学生命科学学院 11 38 4.0 5.0
3 张海燕 河南大学生命科学学院 23 74 4.0 7.0
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研究主题发展历程
节点文献
泛素结合酶(E2)
角毛壳菌
克隆
生物信息学分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
河南大学学报(自然科学版)
双月刊
1003-4978
41-1100/N
大16开
河南省开封市明伦街85号
36-27
1934
chi
出版文献量(篇)
2535
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17
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