栗疫病菌泛素结合酶基因(CpUBC)全长cDNA的电子克隆

• 作者: 兰秀万 冯友军 姜明国 张会敏
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 电子克隆 泛素结合酶 BLAST,Vector NTI
• 年，卷（期）: 2004,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 5-9
• 页数: 5页
• 分类号: Q949.32
• 字数: 1095字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2004.02.002

摘要

电子克隆是一类近来发展起来的,通过有限的部分序列信息探针在Genbank数据库中比对,进而获得全长cDNA的真核基因克隆策略,而且该方法获得的全cDNAD克隆能为RT-PCR所验证.本研究首次应用电子克隆技术从粟疫病菌中克隆到一个1023个核苷酸长度的泛素结合酶基因(CpUBC)的全长cDNA.由NCBI提供的免费ORF Finder软件推导的该基因的开放阅读框(ORF)全长444个核苷酸,且起始密码子ATG及终止密码子TAG分别位于该泛素结合酶基因(CpUBC)cDNA的第245个核苷酸和第686个核苷酸.序列分析表明该基因(CpUBC)与稻瘟菌(Maganaporthe grises)、粗糙脉孢菌(Neurosporacrassa)及绿僵菌(Metarhizium anisopliae)在核苷酸水平的同源性分别为80.0%、73.2%和64.95;在氨基酸水平上的相似性分别为93.8%、72.2%和66.9%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯友军	广西大学生物技术实验中心	4	94	4.0	4.0
2	张会敏	广西大学生物技术实验中心	17	127	6.0	11.0
3	姜明国	广西民族学院化学与生态学院	24	112	7.0	10.0
4	兰秀万	广西医科大学生物化学系	1	20	1.0	1.0