大连海湾仿刺参肠道细菌多样性的16S rDNA分析

• 作者: 侯红漫 张公亮 高美玲
• 来源期刊: 大连工业大学学报
• 学科: 工学
• 关键词: 仿刺参 16S rDNA 肠道细菌 多样性
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 食物与生物工程
• 页码范围: 84-89
• 页数: 6页
• 分类号: TS201.3|Q938.1
• 语种: 中文

摘要

采用构建16S rDNA克隆文库的方法对大连湾仿刺参肠道中的细菌进行了多样性研究,NCBI数据库中序列的Blast比对结果表明,大连湾仿刺参肠道细菌具有高度多样性.挑取149个阳性克隆子,经HinfⅠ和HaeⅢ限制性内切酶谱型分析后得到36个可操作分类单元(OTUs)进行序列测定,克隆文库库容覆盖率为75.8％,结果是大连湾仿刺参肠道细菌分属于14种(属),主要为弧菌(Vibiro),优势菌群为Proteobacteria,占86.1％.用CLUSTALX软件对36个OTUs序列和NCBI基因库中最相似的序列进行分析,应用MEGA 4软件中neighbor-joining方法构建系统发育树,确定大连湾仿刺参肠道细菌与已知菌之间基因系统进化关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	侯红漫		65	253	9.0	13.0
2	张公亮		49	163	7.0	11.0
3	高美玲		8	5	1.0	2.0