红尾副鳅线粒体基因组序列测定与分析

• 作者: 史妍茹 尤平 杨敏 邢连喜 陈涛
• 来源期刊: 陕西师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 红尾副鳅 线粒体基因组 tRNA二级结构 控制区
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 50-56
• 页数: 7页
• 分类号: Q951
• 字数: 4651字
• 语种: 中文

摘要

采用长PCR和嵌套 PCR 相结合的方法测定并注释了红尾副鳅 Paracobitis variegatus （Dabry de Thiersant，1874）线粒体基因组全序列．结果表明：红尾副鳅线粒体基因组全长16571 bp，A＋T含量55．6％，基因构成及排列与其他硬骨鱼基本相同，包含37个基因和1个控制区（D-loop区）．基因组结构紧密，除控制区外基因间仅存在63 bp的间隔，33 bp的重叠．13个蛋白质编码基因中，除了COI基因以GTG作为起始密码子，COII、COIII和Cyt b以不完整的 T，ND4基因以不完整的TA作为终止密码子外，大都以典型的ATG作为起始密码子，以TAA或TAG作为终止密码子．22个tRNA基因的二级结构中，除了 tRNASer（AGN）外，其余21个都可以折叠成典型的三叶草结构，tRNASer（AGN）缺失了DHU臂，在相应位置上只形成一个环．预测了 rRNA的二级结构，其中12S rRNA包含43个茎环结构，16S rRNA包含6个结构域，53个茎环结构．控制区包含1个终止相关序列 TAS1、3个中央保守序列（CSB-F、CSB-D、CSB-E）、2个保守序列区（CSB-2、CSB-3）．

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邢连喜	西北大学生命科学学院	23	72	5.0	8.0
2	杨敏	陕西师范大学生命科学学院	13	290	6.0	13.0
3	尤平	陕西师范大学生命科学学院	23	122	5.0	10.0
4	史妍茹	陕西师范大学生命科学学院	4	18	2.0	4.0
5	陈涛	桂林理工大学国有资产管理处	6	19	2.0	4.0