大豆中GmKAB1基因的克隆和信息学分析

• 作者: 周新安 周蓉 朱晓玲 沙爱华 王程 郝青南 陈李淼 陈水莲 陈海峰
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 钾离子通道基因 克隆 实时荧光定量PCR 生物信息学分析 同源性分析 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 18-24
• 页数: 7页
• 分类号: S565.103
• 字数: 5512字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2014.01.003

摘要

为探讨GmKAB1在大豆处于低钾胁迫下的表达水平,以大豆钾高效品系油06-71和钾敏感型品系衡春04-11为试验材料,设置低钾胁迫试验,分别在处理后0.5h、2h、6h、12h、3d、6d、9d和12d取样提取RNA,利用Realtime-PCR检测各时间段GmKAB1基因的表达量.结果显示GmKAB1基因在地下部分表达比地上部持续时间更长,地下部相对表达倍数最高为3.5,较地上部相对表达倍数更高.克隆目的基因并对基因序列进行同源性及生物信息学分析,结果表明,与GmKAB1基因相似性在30％以上的同源基因有45个,GmKAB1在进化树中的位置与Gly-ma20g19000最近;GmKAB1编码蛋白为稳定的可溶性蛋白,具有2个保守结构域,多个磷酸化位点,表明在受到低钾胁迫后该基因编码的β亚基与α亚基结合调控电压门控钾离子通道,对大豆从根部获取钾离子可能起着关键作用.