中国50个甘蓝代表品种EST-SSR指纹图谱的构建

• 作者: 刘玉梅 吕红豪 庄木 张扬勇 方智远 杨丽梅 王庆彪
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 甘蓝 SSR标记 指纹图谱 品种鉴定
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 111-121
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2014.01.012

摘要

[目的]研究甘蓝DNA指纹鉴定方法,并构建50份中国甘蓝代表品种DNA指纹数据库，为甘蓝品种特异性、真实性、纯度鉴定提供参考依据。[方法]首先，利用6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术和来源不同的甘蓝材料对已开发的甘蓝EST-SSR引物进行筛选，获得多态性引物；然后将可用于甘蓝DNA指纹鉴定的核心引物正义链5′末端分别标记TAMRA、HEX、 ROX、6-FAM四种荧光，利用DNA分析仪检测不同等位变异的扩增片段大小，并确定每个等位变异的标准品种。利用核心引物扩增结合标准品种的片段大小，构建中国50个甘蓝代表品种的SSR指纹数据库。通过人工构建模拟群体对‘中甘21’品种真实性进行鉴定，进而对该指纹鉴定技术进行验证。[结果]利用6份来自中国不同生态条件、植物学性状差异较大的甘蓝品种对978对EST-SSR引物进行初步筛选，获得带型清晰、具有多态性的引物128对。进一步根据引物扩增带型清晰、多态性信息指数较高、不同等位变异的带型易于区分、在染色体上分布均匀原则，筛选出20对核心引物。该套引物可以检测甘蓝染色体20个位点的58个等位变异，平均每条染色体上被检测位点2.22个，平均每个位点包含2.9个等位变异，其中引物BoE607、BoE723等位变异数最多为5个，PIC值处于0.34-0.76之间。通过DNA分析仪检测显示等位变异扩增片段长度范围143-296 bp。利用20对核心引物构建50份中国甘蓝代表品种DNA指纹数据库，并阐述了甘蓝SSR-DNA指纹鉴定的应用和技术流程。本研究还对来自甘蓝主产区的31份‘中甘21’品种进行真实性鉴定，结果显示指纹鉴定与田间鉴结果完全一致。[结论]筛选获得20对核心引物，用于构建中国50个甘蓝代表品种DNA指纹数据库，通过构建人工模拟群体对‘中甘21’品种的真实性进行鉴定，准确率达100%。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王庆彪	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	7	130	6.0	7.0
2	方智远	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	125	2117	24.0	39.0
3	张扬勇	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	64	899	17.0	27.0
4	刘玉梅	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	110	1514	21.0	34.0
5	杨丽梅	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	69	1234	19.0	32.0
6	庄木	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	77	1257	19.0	32.0
7	吕红豪	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	17	164	7.0	12.0