荔波连蕊茶肌动蛋白基因全长cDNA的克隆及其表达分析

• 作者: 李纪元 殷恒福 肖政 范正琪
• 来源期刊: 林业科学研究
• 关键词: 荔波连蕊茶 肌动蛋白基因 序列分析 克隆
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 页码范围: 374-380
• 页数: 7页
• 分类号: S718.46
• 语种: 中文

摘要

根据植物肌动蛋白(Actin)基因编码区的保守序列设计引物,以山茶属植物荔波连蕊茶幼嫩茎段为材料,提取总RNA,进行RT-PCR.采用RACE技术扩增获得1 631 bp的Actin基因全长cDNA序列,命名为ClActinl(GenBank登录号KF366912).序列分析表明,ClActinl 开放阅读框(ORF)为1 134 bp,编码377个氨基酸,5'非编码区90 bp,3'非编码区407 bp.预测的ClActinl蛋白分子量为41.69 kD,理论等电点为5.31,具有Actin超基因家族的保守结构域和肌动蛋白家族特有的特征信号序列.ClActinl与GenBank中收录的其它植物肌动蛋白核苷酸序列的相似性在82％以上,氨基酸序列的相似性在97％以上.与其它植物肌动蛋白比较并构建系统进化树,结果显示山茶肌动蛋白与茶树和杨树的肌动蛋白的亲缘关系最为密切.实时荧光定量PCR结果显示,该基因在荔波边蕊茶不同组织器官及不同发育时期的表达量稳定,表明ClActinl 基因可作为内参基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李纪元	中国林业科学研究院亚热带林业研究所	104	1461	20.0	34.0
2	范正琪	中国林业科学研究院亚热带林业研究所	69	596	14.0	20.0
3	殷恒福	中国林业科学研究院亚热带林业研究所	21	62	5.0	7.0
4	肖政	中国林业科学研究院亚热带林业研究所	3	20	2.0	3.0