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金龙胆草查尔酮合酶基因(CHS)的克隆及其在花期不同组织的表达量分析
金龙胆草查尔酮合酶基因(CHS)的克隆及其在花期不同组织的表达量分析
作者:
刘姗
唐自钟
孙蓉
李成磊
郑天润
陈惠
高静雷
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
金龙胆草
查尔酮合酶(CHS)
克隆
生物信息学分析
表达量分析
摘要:
查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)是植物类黄酮化合物合成的第一关键酶.为了获得金龙胆草(Conyza blinii Lévl.)CHS基因,本研究采用快速扩增cDNA末端(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技术克隆得到了金龙胆草CHS基因的DNA和cDNA全长序列,并进行生物信息学分析,通过RTPCR检测该基因在花期不同组织部位中的表达情况并检测对应部位的相对花青素含量.结果表明,获得的CHS基因DNA全长2 098 bp,包括2个内含子;cDNA全长为1 692 bp,含有完整开放阅读框(1 197 bp),编码399个氨基酸,包含查尔酮合酶的标志性序列,命名为CbCHS(GenBank登录号:KJ155749).序列比对结果显示,金龙胆草CbCHS基因与已报道的其它植物的CHS氨基酸序列具有很高相似性(最高为95%).半定量RT-PCR结果显示,在叶和茎的表达量最高,相对表达量分别达到87.03%和98.33%,表达量之间没有显著差异(P>0.05);在根中CbCHS基因表达量最少,相对表达量仅为9.43%,表达量与其余部位具有显著差异(P<0.05).花青素含量也以茎和叶中最高,根中微量,表明CbCHS基因与花青素的蓄积有一定相关性.本研究首次克隆了金龙胆草CbCHS基因的全长DNA及cDNA序列,研究了其在花期不同组织器官中的表达量差异及与花青素的含量关系,为进一步研究CbCHS基因对金龙胆草黄酮含量的影响及其调控机制提供了基础资料.
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文献信息
篇名
金龙胆草查尔酮合酶基因(CHS)的克隆及其在花期不同组织的表达量分析
来源期刊
农业生物技术学报
学科
关键词
金龙胆草
查尔酮合酶(CHS)
克隆
生物信息学分析
表达量分析
年,卷(期)
2014,(6)
所属期刊栏目
研究论文与报告
研究方向
页码范围
703-711
页数
9页
分类号
字数
5633字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2014.06.005
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
陈惠
四川农业大学生命科学与理学院
108
1021
19.0
26.0
2
刘姗
四川农业大学生命科学与理学院
19
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唐自钟
四川农业大学生命科学与理学院
27
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4.0
6.0
9
孙蓉
四川农业大学生命科学与理学院
16
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4.0
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10
高静雷
四川农业大学生命科学与理学院
4
30
3.0
4.0
11
郑天润
四川农业大学生命科学与理学院
4
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传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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查尔酮合酶(CHS)
克隆
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研究来源
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研究去脉
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期刊影响力
农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
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