油菜Bnpgip2-1基因的克隆表达与生物信息学分析

• 作者: 张家豪 张磊 徐敬友 童蕴慧 陈夕军 陈羽
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白 原核表达 生物信息学分析 核盘菌
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 701-706
• 页数: 6页
• 分类号: S565.403
• 字数: 5095字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2014.06.002

摘要

据GenBank及相关文献提供的序列设计引物,从油菜基因组DNA中扩增出Bnpgip2-1基因完整开放阅读框.该基因全长1 068bp,与已发表的Bnpgip2基因序列(登录号:AF529694)有98％的相似性.RT-PCR分析表明,该基因(已申请序列号为KJ820998)具一个72bp的内含子(544-615),编码区为996bp,含4个限制性内切酶酶切位点(Ava Ⅰ,185;HindⅢ,536;EcoR Ⅰ,929;ApaL Ⅰ,972).原核表达该基因,表达产物能显著抑制油菜菌核病菌多聚半乳糖醛酸酶(PG)活性,抑制率达52.96％.生物信息学分析表明,表达产物BnPGIP2-1有331个氨基酸,理论分子量为36.99kDa,pI为8.35,具强疏水性,主要存在于细胞壁.信号肽切点位于第22和23位氨基酸之间(SFS-KNL),N端和C端各存在5个和3个半胱氨酸残基,可形成3个二硫键;二级结构以α-螺旋(31.12％)、β折叠(16.01％)和无规则线圈(52.87％)为结构元件,具典型的LRR结构;三级结构为10个LRR按右手螺旋规则形成的一个开放裂隙区,可能负责其与病菌PG的互作.该基因的表达受病原菌侵染的强烈诱导,但对水杨酸(SA)处理不敏感,茉莉酸(JA)处理反而使其下调表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张磊	扬州大学园艺与植物保护学院	33	388	7.0	19.0
2	童蕴慧	扬州大学园艺与植物保护学院	82	1786	23.0	41.0
3	徐敬友	扬州大学园艺与植物保护学院	80	1869	25.0	42.0
4	陈夕军	扬州大学园艺与植物保护学院	78	1689	22.0	40.0
5	张家豪	扬州大学园艺与植物保护学院	4	29	3.0	4.0
6	陈羽	扬州大学园艺与植物保护学院	5	19	3.0	4.0