基于16S rDNA和COⅠ基因序列探讨四种溞类的系统关系和分类地位

• 作者: 张晓莉 张海军 徐敏 查岭生 王文平 邓道贵
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 溞属 16S rRNA COⅠ基因 系统分类
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 页码范围: 1040-1046
• 页数: 7页
• 分类号: Q951+.3
• 字数: 4517字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2014.153

摘要

为了检验已记录的4个溞属种类(隆线溞Daphnia carinata 溞、透明 D. hyalina 溞、蚤状 D. pulex和大型溞D. magna)的系统分类,用试剂盒法分别提取4种溞类的基因组DNA。利用特异性引物,通过PCR扩增了4种溞属种类的16S rDNA和COⅠ基因部分序列,并与来自GenBank中每个种类相似度较高的同种序列进行分析。结果表明,基于16S rDNA和COⅠ基因,4个溞属种类的平均种间相似度分别为85.56%和80.67%,碱基中A+T含量均明显高于G+C含量。基于COⅠ基因,溞巢湖隆线与来自GenBank 溞上的拟同形(Daphnia similoides AB549199)相似度为99%,分歧度为0.4%-0.9%。就16S rDNA和COⅠ基因而言,溞巢湖透明更溞接近于盔形(Daphnia galeata)。基于16S rDNA和COⅠ基因构建的NJ树和贝叶斯树,两者的主要分枝基本一致。结果暗示,溞溞巢湖隆线与拟同形为一个种,溞溞透明应属于盔形。由于缺乏核基因的研究,有关巢湖溞属的分类地位还需进行更深入的探讨。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓道贵	淮北师范大学生命科学学院资源植物生物学安徽省重点实验室	46	242	9.0	14.0
2	徐敏	淮北师范大学生命科学学院资源植物生物学安徽省重点实验室	4	5	2.0	2.0
3	张海军	淮北师范大学生命科学学院资源植物生物学安徽省重点实验室	25	77	5.0	7.0
4	王文平	淮北师范大学生命科学学院资源植物生物学安徽省重点实验室	3	3	1.0	1.0
5	张晓莉	淮北师范大学生命科学学院资源植物生物学安徽省重点实验室	4	7	2.0	2.0