一种新的D NA模体发现聚类求精算法

• 作者: 张懿璞
• 来源期刊: 西安电子科技大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 模体发现 聚类 求精
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 页码范围: 95-99
• 页数: 5页
• 分类号: TP301.6
• 字数: 4122字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-2400.2014.06.016

摘要

模体发现问题是分析基因转录调控关系的一个重要方面.提出了一种新的基于熵的聚类求精算法———ECRmotif,用于DNA序列中的模体发现问题.ECRmotif使用灵活的概率模型从背景序列中鉴别模体.它首先使用一个基于熵的聚类过程将数据集划分为若干子集,并对各候选子集压缩其实例的搜索空间,求精得到模体.通过模拟数据和真实数据的实验,表明 ECRmotif 算法可以有效地提高运行速度和效率,并准确地找出模体.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张懿璞	西安电子科技大学计算机学院	4	21	3.0	4.0