大肠杆菌基因组水平蛋白质-RNA相互作用初步研究

• 作者: 付汉江 宋宜 应晓敏 徐淞 李伍举 田宝磊 郑晓飞 陈垚文
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 医学
• 关键词: 蛋白质-RNA相互作用 sRNA 大肠杆菌 MCA
• 年，卷（期）: 2014,（8）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 612-616
• 页数: 5页
• 分类号: Q75|R341
• 字数: 4916字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7644/j.issn.1674-9960.2014.08.011

摘要

目的：初步研究大肠杆菌中基因组水平的蛋白质-RNA相互作用（ protein-RNA interactions，PRI）。方法通过RNA酶消化细菌裂解液，提取与蛋白质相互作用的RNA片段，构建cDNA文库，进行高通量测序，并通过生物信息学分析获得与蛋白质结合的转录本。结果获得了与蛋白质结合的3193条转录本，涉及2234个mRNA、47个sRNA（small regulatory RNAs）、39个tRNA、11个rRNA以及862个基因间区（intergenic region， IGR）。结论初步获得大肠杆菌中与蛋白质相互作用的转录本信息，为进一步开展PRI研究提供了支持。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	田宝磊	军事医学科学院放射与辐射医学研究所	4	16	2.0	4.0
2	郑晓飞	军事医学科学院放射与辐射医学研究所	53	237	7.0	11.0
3	付汉江	军事医学科学院放射与辐射医学研究所	26	84	5.0	6.0
4	应晓敏	军事医学科学院基础医学研究所	14	100	3.0	9.0
5	宋宜	军事医学科学院放射与辐射医学研究所	17	100	6.0	9.0
6	徐淞	军事医学科学院基础医学研究所	1	3	1.0	1.0
7	陈垚文	军事医学科学院基础医学研究所	1	3	1.0	1.0