2011～2012年武汉地区柯萨奇病毒A16型VP1基因的遗传进化分析

• 作者: 伍仕敏 刘为勇 吴建国 吴志强 周虹 李虹泽 项杰
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 柯萨奇病毒A16型 手足口病 重组 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 基础实验诊断研究
• 页码范围: 272-276
• 页数: 5页
• 分类号: R725.1
• 字数: 3585字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2014.04.09

摘要

目的 了解武汉地区手足口病(HFMD)患儿柯萨奇病毒A16型(CA16)的基因型及重组特点.方法 收集2011年4月至2012年3月武汉地区1 844例HFMD患儿的咽拭子标本,用实时荧光定量PCR检测CA16核酸,阳性标本进行病毒分离,对分离株进行VP1基因序列测序,选择2株来自重症和1株来自轻症患几的CA16病毒株构建VP1序列系统进化树并分析其全基因组序列的重组特点.结果 1 844例HFMD患儿的咽拭子标本中分离出42株CA16,VP1序列系统进化分析显示,所有分离株均属于B1亚型,其中13株属于B1a亚群,29株属于B1b亚群.重组分析表明,3株CA16分离株均为亲本株CA16 A型毒株FY18/AH/CHN/2008和EV71 A型毒株Hubei-09/HB/CHN/2009型间重组所产生,重组交叉位点为基因组P2区2A和2B基因交界处.结论 武汉地区的CA16分离株均为B1亚型,其中B1b亚群占明显优势,且CA16分离株存在亲本株CA16A型和EV71 A型毒株的型间重组.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴建国	武汉大学生命科学院	21	56	5.0	6.0
2	项杰	武汉市医疗救治中心检验科	18	73	6.0	8.0
3	吴志强	武汉市医疗救治中心检验科	11	47	4.0	6.0
4	伍仕敏	武汉市医疗救治中心检验科	18	85	6.0	8.0
5	周虹	武汉市医疗救治中心检验科	13	48	4.0	6.0
6	李虹泽	武汉市医疗救治中心检验科	8	55	5.0	7.0
7	刘为勇	武汉大学生命科学院	3	19	2.0	3.0