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摘要:
目的:通过生物信息学方法预测德国小蠊致敏原蛋白Bla g 8的三维结构和抗原表位,为蟑螂引起人类变态反应性疾病的诊断和治疗提供线索.方法:在美国国立生物信息中心(NCBI)上获取Bla g 8致敏原蛋白序列,通过序列比对(BLAST)得到相似序列,应用MEGA6.0构建同源进化树;联合应用DNAStar多种方法预测其抗原表位,使用Modeller 9.12同源建模后经Gromacs能量优化获取稳定的致敏原蛋白.结果:德国小蠊Bla g 8与美洲大蠊肌球蛋白轻链在进化上具有较近的亲缘关系;Bla g 8为含有2个EF手钙结合蛋白位点的α结构疏水性蛋白,主要抗原表位集中于1~24,27 ~ 50,55 ~ 65,69 ~91,92 ~110,121~132,138 ~ 153,159 ~ 180,191 ~208区域;预测并经能量优化后得到稳定的三维结构.结论:通过预测Bla g 8结构及抗原表位,为筛选低致敏原衍生物提供了分子基础.
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文献信息
篇名 德国小蠊致敏原Bla g 8的抗原表位预测及其同源建模
来源期刊 贵阳医学院学报 学科 医学
关键词 致敏原 Bla g 8 抗原 表位 蛋白质序列分析
年,卷(期) 2014,(5) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 669-674
页数 6页 分类号 R384.9
字数 3559字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 张春林 贵阳医学院生物学教研室 67 135 6.0 7.0
2 龙高群 贵阳医学院生物学教研室 5 12 2.0 3.0
3 杨铁 贵阳医学院生物学教研室 2 1 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
致敏原
Bla g 8
抗原
表位
蛋白质序列分析
研究起点
研究来源
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期刊影响力
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大16开
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1958
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