丹参转录因子SmbHLH93的克隆及表达模式分析

• 作者: 周宏骏 晋鑫鑫 武玉翠 王喆之 饶丽华
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 丹参 SmbHLH93 基因克隆 生物信息学 表达模式分析
• 年，卷（期）: 2014,（23）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 3449-3455
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2014.23.018

摘要

目的 克隆丹参碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)类转录因子SmbHLH93,并初步探究该基因的功能.方法 采用PCR和RT-PCR技术分别从DNA和cDNA水平克隆得到了SmbHLH93基因,进一步通过BD Walking获得了该基因的5’启动子区.生物信息学分析SmbHLH93蛋白的理化性质、结构特点和系统进化关系.结合启动子区分析软件和qPCR,研究SmbHLH93在丹参不同部位和环境诱导下的表达模式.结果 获得SmbHLH93基因序列954 bp和5’启动子区1 583 bp,其中开放阅读框(ORF) 657 bp,有3个内含子和4个外显子,编码218个氨基酸,含有bHLH和ACT UUR-ACR-like结构域,无跨膜区域,可能定位于细胞核.表达模式分析结果显示该基因的表达量在根中最高,茎中最低,且随着花的形成逐渐降低.光和低温诱导SmbHLH93的高表达,而水杨酸(SA)抑制其表达.结论 克隆得到丹参bHLH类转录因子新成员SmbHLH93,初步预测其参与了丹参花的发育过程和丹参次生代谢途径的调控.