丹参SmbHLH37基因的克隆、亚细胞定位和表达分析

• 作者: 曹晓燕 李莎莎 杜堂志 杨娜 王晓帆 苏娇 鲁张田子
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 丹参 碱性螺旋-环-螺旋(bHLH) 生物信息学分析 表达分析 亚细胞定位
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 884-892
• 页数: 9页
• 分类号: S184
• 字数: 6441字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2017.06.003

摘要

碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子家族在植物的生长发育、响应非生物胁迫等方面发挥着重要的调控作用.为了进一步丰富丹参(Salvia miltiorrhiza)中该家族成员的研究,寻找新的参与调控丹参次生代谢产物合成相关的bHLH成员,本研究基于丹参转录组和基因组数据库,分别从cDNA和gDNA水平克隆获得SmbHLH37基因序列.该基因序列长l 506 bp,包含1个27 bp的内含子序列,1 479 bp完整的CDS(GenBank登录号:KP257470.1),编码492个氨基酸.BlastP分析结果显示,SmbHLH37与芝麻(Sesamum indicum)等植物的bHLH3同源性较高;SmbHLH37蛋白与拟南芥(Arabidopsis thaliana)bHLH转录因子家族的分子进化树结果显示,SmbHLH37与拟南芥bHLH转录因子AtJAM3(A.thaliana jasmonate-associated MYC2-1ike3)亲缘关系最近.亚细胞定位结果显示,SmbHLH37蛋白主要定位在细胞核中.qRT-PCR分析结果显示,SmbHLH37在叶中的表达量最高,花中最低;用脱落酸(abscisic acid,ABA)和机械诱导处理后,该基因的表达短时间呈上调趋势;同时,SmbHLH37在SmMYC2过表达株系OE-8和OE-12中的表达量显著上调(P＜0.05).研究结果为进一步开展SmbHLH37功能研究提供了基础资料.