一种基于HBV序列的SNP位点检测方法研究

• 作者: 刘立芳 张琪 贺建峰 马磊
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 乙型肝炎 特征选择 风险与预防模式 单核苷酸多态性(SNP)
• 年，卷（期）: 2014,（23）
• 所属期刊栏目: 数据库、数据挖掘、机器学习
• 页码范围: 145-150
• 页数: 6页
• 分类号: TP18|TP311
• 字数: 5359字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.1305-0156

摘要

乙型肝炎病毒（Hepatitis B Virus，HBV）感染作为严重影响人类健康的疾病之一，是导致慢性肝脏疾病、肝硬化和肝癌的主要元凶。HBV由于其自身复制的特殊性，具有高变异特性，据研究表明HBV基因变异是HBV持续感染的根本原因。为了了解HBV的基因变异情况，检测HBV序列的SNP位点即单突变位点已广泛应用于大量的研究，所检测出的SNP位点对指导临床有重要意义。但是目前关于SNP位点检测的方法多因技术难度较高，费用大等不利因素而受到制约。因此，探讨一种基于计算机的SNP位点检测方法成为一种趋势。针对HBV序列的 SNP位点的特点，提出了一种基于最优风险与预防模型的HBV序列的SNP位点检测方法。方法首次应用于HBV序列的SNP位点检测，实验结果表明：该方法不仅有效地检测出HBV序列的X基因片段和前C区基因片段中已经报道的位点，而且还发现了一些新的SNP位点。与硬件检测SNP位点不同的是，所提出的计算机方法具有操作简单和费用低的优点，而且普通实验室和医疗机构均可以承受。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张琪	昆明理工大学信息工程与自动化学院	16	26	2.0	4.0
2	贺建峰	昆明理工大学信息工程与自动化学院	61	281	9.0	13.0
3	马磊	昆明理工大学信息工程与自动化学院	47	127	6.0	9.0
4	刘立芳	昆明理工大学信息工程与自动化学院	2	23	2.0	2.0