肝癌遗传关联研究中LncRNA H19遗传变异的生物信息学分析

• 作者: 刘丽 张俊国 林志丰 王臻 祁永芬 邓煜盛 郜艳晖
• 来源期刊: 广东药学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 肝癌 lncRNA H19 SNP 功能预测
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 医学研究
• 页码范围: 816-819
• 页数: 4页
• 分类号: R735.7
• 字数: 2727字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-8783.2015.06.027

摘要

目的 研究lncRNA H19遗传变异与肝癌易感性的关联,利用生物信息学的方法在实验前期筛选出H19中有潜在功能的SNPs.方法 运用1000 Genomes Project和Ensembl等数据库确定H19 SNPs名录,利用Allele frequency calculator选取MAF值大于0.05的SNPs;结合文献查阅,运用SNP Function Prediction和F-SNP等功能预测软件筛选有潜在功能的SNPs.结果 5个SNPs在转录调控、蛋白质编码以及剪切调控中可能存在相应生物活性,值得进一步研究.结论 对lncRNA H19的SNPs进行了科学合理的选择,可以更全面深入地探寻H19影响肝癌发生发展的遗传机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郜艳晖	广东药学院公共卫生学院	73	645	14.0	21.0
2	刘丽	广东药学院公共卫生学院	21	34	3.0	5.0
3	张俊国	广东药学院公共卫生学院	3	11	2.0	3.0
4	林志丰	广东药学院公共卫生学院	1	3	1.0	1.0
5	邓煜盛	广东药学院公共卫生学院	1	3	1.0	1.0
6	王臻	广东药学院公共卫生学院	1	3	1.0	1.0
7	祁永芬	广东药学院公共卫生学院	1	3	1.0	1.0