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摘要:
目的 研究lncRNA H19遗传变异与肝癌易感性的关联,利用生物信息学的方法在实验前期筛选出H19中有潜在功能的SNPs.方法 运用1000 Genomes Project和Ensembl等数据库确定H19 SNPs名录,利用Allele frequency calculator选取MAF值大于0.05的SNPs;结合文献查阅,运用SNP Function Prediction和F-SNP等功能预测软件筛选有潜在功能的SNPs.结果 5个SNPs在转录调控、蛋白质编码以及剪切调控中可能存在相应生物活性,值得进一步研究.结论 对lncRNA H19的SNPs进行了科学合理的选择,可以更全面深入地探寻H19影响肝癌发生发展的遗传机制.
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文献信息
篇名 肝癌遗传关联研究中LncRNA H19遗传变异的生物信息学分析
来源期刊 广东药学院学报 学科 医学
关键词 肝癌 lncRNA H19 SNP 功能预测
年,卷(期) 2015,(6) 所属期刊栏目 医学研究
研究方向 页码范围 816-819
页数 4页 分类号 R735.7
字数 2727字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1006-8783.2015.06.027
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 郜艳晖 广东药学院公共卫生学院 73 645 14.0 21.0
2 刘丽 广东药学院公共卫生学院 21 34 3.0 5.0
3 张俊国 广东药学院公共卫生学院 3 11 2.0 3.0
4 林志丰 广东药学院公共卫生学院 1 3 1.0 1.0
5 邓煜盛 广东药学院公共卫生学院 1 3 1.0 1.0
6 王臻 广东药学院公共卫生学院 1 3 1.0 1.0
7 祁永芬 广东药学院公共卫生学院 1 3 1.0 1.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
肝癌
lncRNA
H19
SNP
功能预测
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广东药科大学学报
双月刊
1006-8783
44-1733/R
大16开
广州市大学城外环东路280号
46-148
1985
chi
出版文献量(篇)
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23816
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