环介导等温扩增联合横向流动试纸条快速检测扁浒苔(Ulva compressa)的研究

• 作者: 周前进 段维军 王瑞娜 苗亮 陈先锋 陈炯
• 来源期刊: 海洋与湖沼
• 学科: 生物学
• 关键词: 扁浒苔 环介导等温扩增 横向流动试纸条 内转录间隔区 检测
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 页码范围: 819-827
• 分类号: Q948
• 语种: 中文
• DOI: 10.11693/hyhz20150200048

摘要

本研究将环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)与横向流动试纸条(lateral flow dipstick,LFD)的可视化检测方法结合,建立了扁浒苔(Ulva compressa)的LAMP-LFD快速检测技术.该方法以扁浒苔的内转录间隔区(ITS1-5.8S-ITS2)序列为检测靶标,设计了3对特异性引物(其中,上游内引物由生物素标记)和1条异硫氰酸荧光素标记的探针.结果表明,LAMP最适反应温度为63℃,扩增时间为60 min,从核酸扩增到LFD结果判读需70 min.利用LAMP-LFD可特异性检出扁浒苔,对浒苔、曲浒苔、缘管浒苔和孔石莼等石莼属绿藻以及塔玛亚历山大藻、无纹环沟藻、东海原甲藻、锥状斯克里普藻和赤潮异弯藻等常见微藻的检测结果为阴性.该方法最低可检测到0.1 pg的扁浒苔基因组DNA,是以UcoITS-F3和UcoITS-B3为特异性引物的PCR方法的100倍.对实际样品的检测结果表明,LAMP-LFD方法检测扁浒苔与传统的形态学观察的结果一致.因此,该方法可快速、特异地检测出扁浒苔,而且操作简单,仪器设备依赖性低,有潜力成为扁浒苔现场检测的常规技术手段.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈炯	宁波大学海洋学院	100	594	13.0	18.0
2	苗亮	宁波大学海洋学院	43	184	8.0	10.0
3	段维军		19	51	4.0	6.0
4	周前进	宁波大学海洋学院	14	95	6.0	9.0
5	陈先锋	宁波大学海洋学院	22	48	4.0	5.0
9	王瑞娜	宁波大学海洋学院	4	57	4.0	4.0