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摘要:
拟建立施马伦贝格病毒(SBV)S基因焦磷酸测序检测方法,用于施马伦贝格病毒病的快速检测和确诊.通过对公开发表的SBV S基因序列与布尼病毒科其他11种病毒S基因进行比对,找出不同病毒变异区域集中且变异区域两侧保守的序列片段,基因合成,体外转录,作为基因扩增模板.在特异性变异序列两端的保守区域设计扩增引物,进行RT-PCR扩增.在保守区域设计双向测序引物,对RT-PCR产物进行双向焦磷酸测序.通过比对测序结果,确定是否为SBV核酸序列;优化条件,确定检测方法的敏感性、特异性和重复性,建立SBV S基因焦磷酸测序检测方法.结果:建立的施马伦贝格病毒病焦磷酸测序检测方法扩增基因片段长度为166 bp;敏感性为可检测到104个拷贝;每一条测序引物可准确测出50 bp左右核酸序列,双向测序可准确测出100 bp左右核酸序列,具有较好特异性,完全满足施马伦贝格病毒病确诊要求;重复测序3次,均能准确测出100 bp左右核酸序列.本研究建立的施马伦贝格病毒病焦磷酸测序检测方法,可用于施马伦贝格病毒病的检测和确诊,整个检测过程可在1d内完成,大大缩短了确诊时间.
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文献信息
篇名 施马伦贝格病毒病焦磷酸测序检测方法的建立
来源期刊 畜牧兽医学报 学科 农学
关键词 焦磷酸测序 施马伦贝格病毒 S基因
年,卷(期) 2015,(1) 所属期刊栏目 研究简报
研究方向 页码范围 174-178
页数 5页 分类号 S852.659.5
字数 3192字 语种 中文
DOI 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.01.022
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王志亮 134 936 18.0 25.0
2 赵永刚 34 155 7.0 11.0
3 吴晓东 53 281 10.0 14.0
4 张永强 13 103 4.0 10.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
焦磷酸测序
施马伦贝格病毒
S基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
畜牧兽医学报
月刊
0366-6964
11-1985/S
大16开
北京海淀区圆明园西路2号
82-453
1956
chi
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