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摘要:
为建立一种操作简单、结果准确可靠、结果判定直观、成本低廉的现场快速检测方法,为锦鲤疱疹病毒(Koi herpes virus,KHV)疾病的防控提供技术支撑,根据KHV保守的DNA聚合酶(DNA polymerase,Sph)基因,设计一组单交叉扩增引物,以构建的Sph基因重组质粒作为标准DNA模板,采用单交叉引物等温扩增技术(single cross priming amplification,SCPA)进行扩增,优化反应体系的引物浓度组合、Mg2+浓度、dNTPs浓度、反应温度和时间,并结合核酸试纸条技术(nucleic acid test strip detection method),建立了快速可视化检测锦鲤疱疹病毒的单交叉引物等温扩增检测方法(KHV-SCPA).结果表明,最佳引物浓度组合为引物2a1s1.0 μmol/L,2a(2a-Bio)和3a(3a-FIT)各0.5μmol/L,4s和5a各0.6μmol/L,Mg2+浓度为8.0 mmol/L,dNTPs浓度为1.2 mmol/L,反应温度63℃,时间60 min.本实验扩增产物经凝胶电泳呈现梯形条带,可特异性地检测出KHV,灵敏度较常规PCR方法提高约1 000倍.带有探针的反应产物采用核酸试纸条检测,在3~5 min内即可通过条带出现与否对反应产物进行可视化检测.KHV-SCPA检测方法不依赖昂贵的仪器设备与专业技术人员,可应用于锦鲤疱疹病毒的现场快速检测中,为锦鲤疱疹病毒病的准确快速诊断和有效防控提供了技术支撑.
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文献信息
篇名 锦鲤疱疹病毒单交叉引物等温扩增检测方法的建立
来源期刊 水产学报 学科 农学
关键词 锦鲤疱疹病毒 交叉引物 等温扩增 核酸试纸条 检测
年,卷(期) 2015,(9) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 1422-1431
页数 分类号 S941.41
字数 语种 中文
DOI 10.11964/jfc.20150409805
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 徐进 中国水产科学研究院长江水产研究所 36 359 11.0 17.0
2 曾令兵 上海海洋大学水产与生命学院 56 582 14.0 22.0
4 周勇 中国水产科学研究院长江水产研究所 36 264 9.0 15.0
5 刘文枝 中国水产科学研究院长江水产研究所 15 35 3.0 5.0
8 李聪慧 上海海洋大学水产与生命学院 1 2 1.0 1.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
锦鲤疱疹病毒
交叉引物
等温扩增
核酸试纸条
检测
研究起点
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水产学报
月刊
1000-0615
31-1283/S
大16开
上海市临港新城沪城环路999号
4-297
1964
chi
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