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锦鲤疱疹病毒单交叉引物等温扩增检测方法的建立
锦鲤疱疹病毒单交叉引物等温扩增检测方法的建立
作者:
刘文枝
周勇
徐进
曾令兵
李聪慧
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
锦鲤疱疹病毒
交叉引物
等温扩增
核酸试纸条
检测
摘要:
为建立一种操作简单、结果准确可靠、结果判定直观、成本低廉的现场快速检测方法,为锦鲤疱疹病毒(Koi herpes virus,KHV)疾病的防控提供技术支撑,根据KHV保守的DNA聚合酶(DNA polymerase,Sph)基因,设计一组单交叉扩增引物,以构建的Sph基因重组质粒作为标准DNA模板,采用单交叉引物等温扩增技术(single cross priming amplification,SCPA)进行扩增,优化反应体系的引物浓度组合、Mg2+浓度、dNTPs浓度、反应温度和时间,并结合核酸试纸条技术(nucleic acid test strip detection method),建立了快速可视化检测锦鲤疱疹病毒的单交叉引物等温扩增检测方法(KHV-SCPA).结果表明,最佳引物浓度组合为引物2a1s1.0 μmol/L,2a(2a-Bio)和3a(3a-FIT)各0.5μmol/L,4s和5a各0.6μmol/L,Mg2+浓度为8.0 mmol/L,dNTPs浓度为1.2 mmol/L,反应温度63℃,时间60 min.本实验扩增产物经凝胶电泳呈现梯形条带,可特异性地检测出KHV,灵敏度较常规PCR方法提高约1 000倍.带有探针的反应产物采用核酸试纸条检测,在3~5 min内即可通过条带出现与否对反应产物进行可视化检测.KHV-SCPA检测方法不依赖昂贵的仪器设备与专业技术人员,可应用于锦鲤疱疹病毒的现场快速检测中,为锦鲤疱疹病毒病的准确快速诊断和有效防控提供了技术支撑.
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内容分析
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关键词热度
相关文献总数
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文献信息
篇名
锦鲤疱疹病毒单交叉引物等温扩增检测方法的建立
来源期刊
水产学报
学科
农学
关键词
锦鲤疱疹病毒
交叉引物
等温扩增
核酸试纸条
检测
年,卷(期)
2015,(9)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
1422-1431
页数
分类号
S941.41
字数
语种
中文
DOI
10.11964/jfc.20150409805
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
徐进
中国水产科学研究院长江水产研究所
36
359
11.0
17.0
2
曾令兵
上海海洋大学水产与生命学院
56
582
14.0
22.0
4
周勇
中国水产科学研究院长江水产研究所
36
264
9.0
15.0
5
刘文枝
中国水产科学研究院长江水产研究所
15
35
3.0
5.0
8
李聪慧
上海海洋大学水产与生命学院
1
2
1.0
1.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
(95)
参考文献
(31)
节点文献
引证文献
(2)
同被引文献
(9)
二级引证文献
(1)
1938(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1985(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1988(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1990(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1992(2)
参考文献(0)
二级参考文献(2)
1993(3)
参考文献(0)
二级参考文献(3)
1995(4)
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1996(3)
参考文献(0)
二级参考文献(3)
1997(3)
参考文献(0)
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1998(2)
参考文献(0)
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二级参考文献(6)
2000(11)
参考文献(0)
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2001(4)
参考文献(0)
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参考文献(1)
二级参考文献(16)
2003(15)
参考文献(0)
二级参考文献(15)
2004(15)
参考文献(0)
二级参考文献(15)
2005(19)
参考文献(1)
二级参考文献(18)
2006(19)
参考文献(1)
二级参考文献(18)
2007(14)
参考文献(1)
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2008(9)
参考文献(0)
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参考文献(2)
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参考文献(4)
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参考文献(1)
二级参考文献(0)
2015(1)
参考文献(1)
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引证文献(0)
二级引证文献(0)
2016(1)
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2019(1)
引证文献(1)
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2020(1)
引证文献(0)
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研究主题发展历程
节点文献
锦鲤疱疹病毒
交叉引物
等温扩增
核酸试纸条
检测
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
水产学报
主办单位:
中国水产学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-0615
CN:
31-1283/S
开本:
大16开
出版地:
上海市临港新城沪城环路999号
邮发代号:
4-297
创刊时间:
1964
语种:
chi
出版文献量(篇)
3756
总下载数(次)
11
总被引数(次)
60406
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