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百子莲生长素受体基因TIR1的全长cDNA克隆及功能分析
百子莲生长素受体基因TIR1的全长cDNA克隆及功能分析
作者:
岳建华
张荻
申晓辉
邹梦雯
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
百子莲
生长素受体基因
TIR1
克隆
基因表达
摘要:
采用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)方法获得百子莲生长素受体TIR1基因cDNA全长序列,对该序列进行生物信息学分析的结果显示,TIR1基因的mRNA序列全长为2 235 bp;5'非编码区296 bp,3’非编码区172 bp;该基因的ORF全长为1 764bp,编码一个含有588个氨基酸的蛋白.百子莲TIR1推导蛋白序列与葡萄(Vitis vini era)、二穗短柄草(Brach ypodium distach yon)、高粱(Sorghum bicolor),玉米(Zeamays)等植物均具有较高的同源性,同源性最高的是葡萄,可达78%.系统进化树表明,百子莲与葡萄距离最近.由α-螺旋,随机卷曲和延伸链组成一个磁状结构,为亲水蛋白,疏水性值为-0.092,在百子莲体细胞胚胎发生过程中,实时荧光定量PCR结果表明TIR1基因表达量在愈伤组织中含量最低,在胚性愈伤组织和体细胞胚胎中含量均有所升高,而在体胚幼苗中表达量最高,表明该基因介导的生长素信号在体细胞胚胎发生过程中发挥着非常重要的作用.
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文献信息
篇名
百子莲生长素受体基因TIR1的全长cDNA克隆及功能分析
来源期刊
上海交通大学学报(农业科学版)
学科
农学
关键词
百子莲
生长素受体基因
TIR1
克隆
基因表达
年,卷(期)
2015,(3)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
36-42,52
页数
8页
分类号
S682.32
字数
4281字
语种
中文
DOI
10.3969/J.ISSN.1671-9964.2015.03.006
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张荻
上海交通大学农业与生物学院
157
1845
23.0
35.0
2
岳建华
上海交通大学农业与生物学院
2
5
2.0
2.0
3
申晓辉
上海交通大学农业与生物学院
31
234
9.0
14.0
4
邹梦雯
上海交通大学农业与生物学院
2
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传播情况
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引文网络
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引证文献(1)
二级引证文献(1)
2019(4)
引证文献(1)
二级引证文献(3)
研究主题发展历程
节点文献
百子莲
生长素受体基因
TIR1
克隆
基因表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
上海交通大学学报(农业科学版)
主办单位:
上海交通大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1671-9964
CN:
31-1837/S
开本:
大16开
出版地:
上海市七莘路2678号36号信箱
邮发代号:
4-695
创刊时间:
1983
语种:
chi
出版文献量(篇)
1979
总下载数(次)
4
总被引数(次)
20134
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
期刊文献
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上海交通大学学报(农业科学版)2015年第5期
上海交通大学学报(农业科学版)2015年第4期
上海交通大学学报(农业科学版)2015年第3期
上海交通大学学报(农业科学版)2015年第2期
上海交通大学学报(农业科学版)2015年第1期
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