森林脑炎病毒Vero细胞适应株的全基因组序列分析

• 作者: 刘双军 孙宏亮 宋宗明 张朔 李野 王伟 王涛 邢坤鹏 麻红梅
• 来源期刊: 中国生物制品学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 森林脑炎病毒 Vero细胞 序列分析
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 疫苗研究
• 页码范围: 553-556
• 分类号: R373.3+1|Q71
• 语种: 中文

摘要

目的 对森林脑炎病毒(tick-borne encephalitis virus,TBEV)森“张”株在Vero细胞上的适应株(以下称SZV株)进行全基因组测序,并与TBEV远东亚型的其他毒株、欧洲亚型毒株进行比较.方法 设计TBEV的特异性引物,提取SZV株病毒总RNA,以其为模板,采用RT-PCR方法分段扩增序列并测序,应用Vector NTI 9.0软件进行拼接,并与森“张”株、GenBank中报道的TBEV远东亚型Oshima 5-10株、Sofjin-HO株及欧洲亚型263株、Neudoerfl株的全长基因序列进行比对分析.结果 SZV株的全基因组由10 782个核苷酸组成,仅编码1个开放阅读框,长度为10 245个核苷酸,共编码3 414个氨基酸.SZV株与TBEV远东亚型的Oshima5-10株和Sofjin-HO株ORF区编码的氨基酸序列同源性分别为95.0％和94.6％,与TBEV欧洲亚型的典型毒株263株和Neudoerfl株ORF区编码的氨基酸序列同源性分别为91.1％和91.0％.结论 对TBEV Vero细胞适应株SZV进行了全基因组序列测定及分析,为研制基于Vero细胞基质的森林脑炎疫苗奠定了基础.