药用模式真菌灵芝小G蛋白基因家族的系统性分析

• 作者: 任昂 吴风礼 姜爱良 师亮 曹鹏飞 李梦娇 赵明文
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 灵芝 小G蛋白 功能域分析 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 页码范围: 923-929
• 分类号: Q939.96
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/j.issn.1000-2030.2015.06.008

摘要

[目的]利用比较基因组学方法,对药用模式真菌灵芝的基因组中的小G蛋白基因家族成员进行系统的预测分析和比较.[方法]利用真菌物种中已经报道的小G蛋白,对灵芝全基因组进行BLAST分析,筛选出所有灵芝的小G蛋白基因,并分析这些同源小G蛋白的基本特性.通过小C蛋白家族的进化树分析和功能域分析,解析灵芝小C蛋白家族成员的进化关系.设计每一个小G蛋白同源基因的特异性引物,通过实时荧光定量PCR检测小G蛋白同源基因的表达.[结果]在灵芝中发现了29个小G蛋白家族基因,其中Ras亚家族4个,Rho亚家族4个,Rab亚家族12个,Arf亚家族7个,Ran亚家族1个,还有1个线粒体小G蛋白.菌丝体中有28个小G蛋白基因表达.[结论]根据真菌中已知的小G蛋白系统性地分析了灵芝的小G蛋白家族成员,进行灵芝小G蛋白的特性分析和基因实时荧光定量PCR检测,为下一步研究灵芝小G蛋白家族成员的功能奠定基础.