基于分段氨基酸组成预测β-琼胶酶的最适温度

• 作者: 产竹华 张光亚 易志伟 曾润颖 楚云猛
• 来源期刊: 计算机与应用化学
• 学科: 化学
• 关键词: β-琼胶酶 氨基酸组成 最适温度 支持向量机回归
• 年，卷（期）: 2015,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1513-1518
• 页数: 6页
• 分类号: TQ015.9|TP391.9|O6-39
• 字数: 4176字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11719/com.app.chem20151225

摘要

为了探究氨基酸组成对β-琼胶酶催化底物时的最适温度的影响,分别统计分析了酶全长、N端、M段及C端序列中20种氨基酸出现的频次.以支持向量机回归构建了氨基酸组成与β-琼胶酶最适温度的模型,10-倍交叉验证获得最小平均绝对误差( MAE ),线性核函数的M端为4.36℃,RBF核函数的M端为4.16℃,独立样本测试得到N端的MAE分别为3.12℃和4.43℃.上述结果表明,该酶N端和M端是影响其最适温度的重要因素.通过比较最适温度为60℃和30℃β-琼胶酶的高级结构,推测M端和N端中3个螺旋结构是影响该酶最适温度的重要因素.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张光亚	华侨大学化工学院生物工程与技术系	88	491	10.0	20.0
2	产竹华	国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室	16	46	4.0	5.0
3	易志伟	华侨大学化工学院生物工程与技术系	8	19	3.0	4.0
5	楚云猛	华侨大学化工学院生物工程与技术系	2	3	1.0	1.0
8	曾润颖	华侨大学化工学院生物工程与技术系	1	1	1.0	1.0