野生花生全基因组抗病相关 LOX 基因的生物信息学分析

• 作者: 乔善良 侯蕾 宋辉 李爱芹 王兴军 赵传志 赵术珍
• 来源期刊: 山东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 野生花生 LOX 基因家族 抗病 系统发育 选择压力
• 年，卷（期）: 2015,（10）
• 所属期刊栏目: 生物技术?遗传育种?种质资源
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: S656.201
• 字数: 4664字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14083/j.issn.1001-4942.2015.10.001

摘要

脂肪氧合酶（lipoxygenases，LOX）是生物体内一种重要的双加氧酶，其在植物发育以及响应生物和非生物胁迫时发挥重要作用。本研究从 Arachis duranensis 和 Arachis ipaёnsis 两个野生花生基因组中各鉴定出18个 LOX 基因，分别命名为 AdLOX1～18和 AiLOX1～18。在 AdLOX5、AdLOX7、AiLOX8和 AiLOX18基因的CDS 序列中发现提前终止翻译的终止密码子，而 AiLOX9基因的 CDS 序列过短，推测这些基因可能是假基因。染色体定位结果显示，AdLOX 和 AiLOX 基因主要分布在2、3、6、8、9和10号染色体上，且其直系同源基因分布在两套染色体相同或相近的位置。通过分析 AdLOX 和 AiLOX 基因与已知功能 LOX 基因的亲缘关系发现，Ad-LOX6、AdLOX9、AdLOX11、AdLOX12、AdLOX17、AiLOX1、AiLOX4、AiLOX6、AiLOX16和 AiLOX17基因可能参与花生的抗病过程，启动子分析结果也支持这一结论。基因选择压力研究表明，AdLOX 和 AiLOX 基因在进化历程中受到纯化选择。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵传志	山东省农业科学院生物技术研究中心	10	74	4.0	8.0
2	赵术珍	山东省农业科学院生物技术研究中心	7	27	4.0	5.0
3	王兴军	山东省农业科学院生物技术研究中心	12	116	6.0	10.0
4	李爱芹	山东省农业科学院生物技术研究中心	20	234	6.0	15.0
5	侯蕾	山东省农业科学院生物技术研究中心	4	18	2.0	4.0
6	宋辉	山东省农业科学院生物技术研究中心	1	2	1.0	1.0