番茄 RGA4蛋白与马铃薯 Rpi-blb1蛋白的同源比较分析

• 作者: 武安泉 王俊生 范小芳 阮先乐 陈龙
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄 晚疫病 垂直同源 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传与育种
• 页码范围: 420-427
• 页数: 8页
• 分类号: Q943.2|S641.2
• 字数: 6238字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201403048

摘要

为获得番茄抗晚疫病广谱性基因信息,采用同源电子克隆法,基于番茄蛋白序列数据库,以马铃薯晚疫病广谱抗性蛋白 Rpi-blb1为种子序列,获得番茄疾病抗性蛋白 RGA4,并进行基因电子定位和基因结构、模体、二级结构、基因进化及基因电子表达等分析,以证明两者的进化关系.结果表明：番茄 RGA4蛋白(XP_004245923．1)序列具有 NB-ARC 和 LRR8两个保守结构域,定位于第8条染色体 SL2．40区间,相应基因位于8号染色体序列的57228847－57232935 bp 区间,长度为4089 bp,由2个外显子和1个内含子组成,编码988个氨基酸序列,该蛋白为不稳定分泌球形蛋白；番茄 RGA4蛋白和马铃薯 Rpi-blb1蛋白在二级结构分布、基因序列组成、基因定位等方面相似性较高,可确定两者为垂直同源关系,但在基因进化和模体组成方面存在差异,可能导致两者功能上的不同.研究结果可为番茄晚疫病广谱抗性基因克隆及其利用提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈龙	周口师范学院生命科学与农学学院	80	656	13.0	22.0
2	阮先乐	周口师范学院生命科学与农学学院	30	63	5.0	7.0
3	武安泉	周口师范学院生命科学与农学学院	31	113	6.0	9.0
4	王俊生	周口师范学院生命科学与农学学院	30	48	4.0	5.0
5	范小芳	周口师范学院生命科学与农学学院	11	24	3.0	4.0