烟草表达抗病基因同源物(RGA)的鉴定及RGA-SSR标记的开发

• 作者: 张振臣 李淑玲 李集勤 袁清华 谢锐鸿 陈俊标 马柱文
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 烟草 表达序列标签 抗病基因同源物 SSR
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 240-252
• 页数: 13页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2014.00240

摘要

烟草是研究植物与病原菌互作的理想材料.鉴定烟草抗病基因及其同源物对揭示抗病机制具有重要意义.近年来公共数据库不断增长的EST序列为烟草表达RGA的鉴定提供丰富的数据.本研究通过拼接GenBank收录的412 325条烟草EST序列,获得149 606条Uni-EST序列.随后利用已克隆的112个植物R基因蛋白序列对其扫描,检测出1113个NtRGA,其中有273、546、53、102和30个分别包含NBS-LRR、LRR-PK、LRR、PK和Mlo结构域,另有109个未检测到结构域.通过序列比对将1071个NtRGA定位于N.benthamiana基因组712个位点上.经搜索,从72个NtRGA中检测出78个SSR,根据其侧翼序列设计64对引物.54对成功从烟草基因组DNA中扩增出清晰条带,9对在24个普通烟草品种间检测出多态性,检出等位基因数2～4个,平均2.56个;41对在6个烟草种间检测出多态性,检出等位基因数2～4个,平均2.61个.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李淑玲	广东省农业科学院作物研究所	25	226	8.0	14.0
2	陈俊标	广东省农业科学院作物研究所	21	96	5.0	9.0
3	张振臣	广东省农业科学院作物研究所	13	69	5.0	8.0
4	袁清华	广东省农业科学院作物研究所	12	39	4.0	6.0
5	马柱文	广东省农业科学院作物研究所	8	48	3.0	6.0
6	谢锐鸿	广东省农业科学院作物研究所	5	15	3.0	3.0
7	李集勤	广东省农业科学院作物研究所	7	15	2.0	3.0