番茄水通道蛋白基因SIAQP的克隆与序列分析

• 作者: 吴新新 李仁 李蔚 杨荣超 温常龙 赵冰 赵永钦 郭仰东
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄 水通道蛋白 序列分析 细胞定位 Real time-PCR
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 302-310
• 分类号: S641.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.02.012

摘要

[目的]通过分析克隆得到的番茄水通道蛋白SIAQP基因的cDNA全长序列特征、编码蛋白的细胞定位及其在番茄材料Mirco Tom中经干旱胁迫后的表达模式,为进一步研究番茄在逆境下的抗逆机制及加快番茄抗逆育种积累资料.[方法]采用RACE技术克隆番茄水通道蛋白基因的cDNA全长,结合生物信息学软件分析该基因的编码蛋白特性；利用基因枪转化法将S1AQP基因与GFP融合的瞬时表达载体(S1AQP::GFP)转入洋葱表皮细胞,对该基因进行亚细胞定位；利用Real time-PCR分析该基因在番茄品种Mirco Tom中经干旱胁迫下的表达机制.[结果]S1AQP基因(GenBank登录号:HQ433337)cDNA全长为1 107 bp,编码区含852 bp,共编码283个氨基酸.生物信息学软件分析表明,SIAQP基因含有6个跨膜区,2个NPA单元,其氨基酸残基与MIP家族蛋白保守区序列完全一致,且该基因氨基酸序列与其它物种PIP类质膜型水通道蛋白氨基酸序列具有很高的同源性.11个物种间的聚类分析表明,S1AQP基因编码的蛋白与马铃薯质膜型水通道蛋白遗传距离最近.细胞定位结果确认S1AQP基因编码蛋白在细胞质膜上发挥生物学作用.Southern杂交结果显示,S1AQP基因在番茄基因组DNA中呈单拷贝.Real time-PCR分析结果证实,干旱胁迫下该基因表达量总体呈下降趋势.[结论]对番茄水通道蛋白S1AQP基因在干旱胁迫后的表达模式分析,预示该基因表达受逆境条件的影响,为今后进一步探讨其在干旱胁迫中发挥的作用提供了重要信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李蔚	中国农业大学农学与生物技术学院	9	69	5.0	8.0
2	李仁	中国农业大学农学与生物技术学院	9	75	6.0	8.0
3	赵冰	中国农业大学农学与生物技术学院	44	589	11.0	23.0
4	赵永钦	中国农业大学农学与生物技术学院	8	109	6.0	8.0
5	吴新新	中国农业大学农学与生物技术学院	7	96	6.0	7.0
6	温常龙	中国农业大学农学与生物技术学院	6	65	5.0	6.0
7	杨荣超	中国农业大学农学与生物技术学院	5	188	5.0	5.0