蓖麻SnRK2基因家族的鉴定和特征分析

• 作者: 刘旭云 刘爱忠 和珊 敖涛 胡学礼 胡尊红
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 蓖麻 SnRK2 蛋白激酶 ABA NaCl 冷胁迫
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 160-166
• 页数: 7页
• 分类号: S565.603
• 字数: 5245字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2015.02.006

摘要

SnRK2是一类植物特有的Ser/Thr类蛋白激酶.为研究其在蓖麻抗逆过程中的作用,基于蓖麻的基因组序列信息,利用生物信息学方法鉴定了6个蓖麻SnRK2蛋白激酶成员.分析发现这些蛋白具有亲水性属性,基因结构分析表明,植物SnRK2基因在进化过程中具有很高的保守性;系统与进化分析发现植物SnRK2蛋白在单、双子叶植物中分化显著,可能是独立演化的结果.高通量RNA-seq测序结果显示,大部分SnRK2基因在检测的各个组织中均有表达,且在不同组织间或种子发育的不同阶段没有明显的组织特异性;外源ABA处理种子后,Group 2的基因表达显著上调.进一步利用半定量RT-PCR技术检测外源(100μmol/L)ABA、(250mmol/L) NaCl和(4℃)冷胁迫处理的幼苗,发现Group 2中的基因29908.m006067被这3种胁迫强烈激活,基因29772.m000313对ABA和冷胁迫有较强的响应.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡学礼	云南省农业科学院经济作物研究所	31	184	7.0	12.0
2	刘旭云	云南省农业科学院经济作物研究所	37	283	8.0	15.0
3	胡尊红	云南省农业科学院经济作物研究所	20	125	5.0	11.0
4	和珊	中国科学院昆明植物研究所	1	4	1.0	1.0