HBsAb 滴度高于10000 mU／ml外周血BCR CDR3受体库的组成及特征分析

• 作者: 姚新生 潘娟 石彬 马龙
• 来源期刊: 中国免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: Illumina高通量测序技术 乙肝表面抗体 BCR CDR3受体库 乙肝病毒
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 基础免疫学
• 页码范围: 300-303
• 页数: 4页
• 分类号: R392.33
• 字数: 2302字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-484X.2015.03.003

摘要

目的：分析HBsAb滴度＞10000 mU／ml外周血 BCR CDR3受体库的组成及特征，寻找可能的HBsAb 序列，为维持后续研究提供数据基础。方法：提取 HBsAb 滴度高于10000 mU／ml 样本的 PBMC 总 DNA，外送美国 Adaptive Biotechnologies ImmunoSEQ平台行Illumina Solexa高通量测序，用IMGT数据库中的High V-QUEST软件初步分析BCR CDR3受体库IGHV、IGHJ和IGHD基因亚群的分布情况、IGHV-J配对取用情况、CDR3区氨基酸长度分布及氨基酸取用情况，并与NCBI数据库中HBsAb序列进行比对。结果：实验样本均高频取用基因亚群IGHV3、IGHV4，IGHJ4、IGHJ6，IGHD3、IGHD6；高频取用配对IGHV3-J4、IGHV3-J6。 CDR3区氨基酸长度均以14及15个氨基酸长度为中线呈正态分布，高频取用的氨基酸依次为Y、G、D、A、R、S，在107、108、109、113、114位点呈现氨基酸多样性取用，在105、106、115、116、117位点上取用氨基酸保守。与NCBI数据库中HBsAb序列比对，得到IGHV、IGHJ、CDR3氨基酸长度完全一致的独特序列共48条。结论：HBsAb 滴度高于10000 mIU／ml样本BCR CDR3受体库的组成具备基本一致的特征，获得的48条独特序列为维持后续研究提供了坚实的数据基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姚新生	遵义医学院免疫教研室	76	410	12.0	17.0
2	潘娟	遵义医学院附属医院检验科	14	32	3.0	5.0
3	石彬	遵义医学院附属医院检验科	10	14	3.0	3.0
4	马龙	遵义医学院免疫教研室	13	24	3.0	4.0