烟草电压依赖阴离子通道 NtVDAC1．1的电子克隆及生物信息学分析

• 作者: 张小全 杨铁钊 武兆云 王红
• 来源期刊: 山东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 烟草 电压依赖阴离子通道 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 生物技术?遗传育种?种质资源
• 页码范围: 5-11
• 页数: 7页
• 分类号: S572|Q781
• 字数: 3506字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14083/j.issn.1001-4942.2015.11.002

摘要

为研究电压依赖阴离子通道（VDAC）基因在烟草根系分泌有机酸的作用，进而为了解该基因的功能和应用提供基础，以拟南芥 AtVDAC1（NM＿110994）为搜索序列，应用电子克隆技术得到一条烟草 VDAC基因全长 cDNA，命名为 NtVDAC1．1。生物信息学分析表明该基因全长为1018 bp，有着完整的开放阅读框，编码276个氨基酸。进化关系及同源性分析表明，NtVDAC1．1与其他物种的 VDAC 有着较高的相似性，其中与茄科植物马铃薯三个膜孔蛋白有着很高的一致性（0．768～0．902）。功能分析显示，NtVDAC1．1为膜孔蛋白，参与了阴离子的转运、阴离子转运调节和跨膜运输。二级和四级结构分析均表明，NtVDAC1．1含有α－螺旋和β－折叠。氨基酸位点分析表明，该蛋白具有多种类型的修饰位点，其中的磷酸化位点说明该基因与信号转导有关，对阴离子通道活性具有调节作用。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨铁钊	河南农业大学烟草学院	186	2822	28.0	43.0
2	张小全	河南农业大学烟草学院	93	980	17.0	25.0
3	武兆云	河南农业大学烟草学院	8	28	2.0	5.0
4	王红	河南农业大学烟草学院	1	2	1.0	1.0