12种真菌钾离子通道蛋白生物信息学分析

• 作者: 周威 李红波 胡梁斌 莫海珍 赵岩岩 辛董董
• 来源期刊: 食品工业科技
• 学科: 工学
• 关键词: 真菌 钾离子通道蛋白 理化性质 结构特征
• 年，卷（期）: 2018,（16）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 98-103,110
• 页数: 7页
• 分类号: TS201
• 语种: 中文
• DOI: 10.13386/j.issn1002-0306.2018.16.018

摘要

利用生物信息学对真菌钾离子通道蛋白进行序列分析,推断并预测其结构和功能.本文筛选了酿酒酵母、黄曲霉、烟曲霉、禾谷镰刀菌、玉米黑粉菌、布拉克须霉等12种真菌的钾离子通道蛋白,综合采用Blast、ProtParam、SignalP和Swiss-Model等生物信息学网站和软件对这些蛋白的理化性质、系统进化、蛋白结构和功能域等进行了分析.结果表明:所选择的钾离子通道蛋白氨基酸序列长度在659～928 aa之间,理论等电点在5.45～9.54之间,主要定位在质膜、液泡上.二级结构分析表明,真菌钾离子通道蛋白均由α-螺旋、β-折叠、无规则卷曲和延伸链等结构元件组成,其空间结构高度相似,且12种钾离子通道蛋白都拥有保守的TxGYGD钾离子选择器特征片段.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡梁斌	河南科技学院食品学院	37	224	9.0	13.0
2	莫海珍	河南科技学院食品学院	51	278	10.0	14.0
3	辛董董	河南科技学院食品学院	8	11	2.0	3.0
4	李红波	河南科技学院食品学院	14	46	4.0	6.0
5	赵岩岩	河南科技学院食品学院	12	33	3.0	5.0
6	周威	河南科技学院食品学院	13	39	4.0	6.0