变异链球菌SMU.2055蛋白晶体结构及其小分子抑制剂设计与筛选

• 作者: 吴昕彧 展秀荣 赵春燕 赵望泓 陈晓丹
• 来源期刊: 华西口腔医学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 变异链球菌 蛋白质晶体学 小分子抑制剂
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 专栏论著
• 页码范围: 182-186
• 页数: 5页
• 分类号: Q 51
• 字数: 4337字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7518/hxkq.2015.02.016

摘要

目的：研究变异链球菌UA159中SMU.2055蛋白的三维晶体结构，并基于其结构进行小分子抑制剂的设计与筛选。方法运用结构基因组学研究方法，通过基因克隆和表达、蛋白质纯化、晶体筛选、晶体衍射数据收集，解析SMU.2055蛋白三维晶体结构，并运用计算机辅助药物设计方法，利用Libdock、Autodock两种程序，通过虚拟筛选和精确对接方式，建立与SMU.2055结构相匹配的小分子抑制剂虚拟模型。结果获得SMU.2055蛋白结晶，解析SMU.2055蛋白三维晶体结构，晶体衍射率为0.23?nm，属于C2221空间群，晶胞参数为a=9.20 nm，b=9.46 nm，c=19.39?nm，溶剂体积分数为56.7%。设计并筛选出与SMU.2055蛋白结构匹配度高的5个小分子化合物。结论变异链球菌SMU.2055蛋白质晶体学研究有助于从分子水平上深入了解变异链球菌蛋白质的结构和功能，筛选出的5个小分子化合物可能成为SMU.2055的有效小分子抑制剂，所建立的小分子抑制剂虚拟模型为基于蛋白质结构的防龋研究奠定基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵春燕	兰州大学药学院	12	41	4.0	6.0