甜高粱SUT1基因克隆、表达及生物信息学分析

• 作者: 唐呈瑞 戴凌燕 李明 杜吉到 殷奎德 符楠
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 甜高粱 蔗糖转运蛋白 SUT1基因 表达 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（12）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 2276-2286
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2015.12.2276

摘要

为获知甜高粱蔗糖转运蛋白基因SUT1及其功能,采用同源克隆方法结合RACE技术克隆甜高粱SUT1基因,并对其进行生物信息学分析.克隆得到甜高粱蔗糖转运蛋白基因SUT1 cDNA全长为2 472bp,包括1 560bp编码区序列,编码含有519个氨基酸的蛋白.该蛋白是1个疏水性膜蛋白,分子量约为55kDa,理论等电点pI为8.86;无信号肽剪切位点,含有12个明显的跨膜螺旋拓扑结构,预测含有6个丝氨酸激酶磷酸化位点、4个苏氨酸激酶磷酸化位点和2个酪氨酸激酶磷酸化位点;包含1段低复杂度序列和12个保守的跨膜螺旋结构域.在亚细胞水平,SUT1主要定位于叶绿体类囊体膜、质膜、高尔基体及内质网膜上;二级结构主要以α-螺旋为主,其中α-螺旋占43.35％,无规则卷曲占34.68％,延伸链占19.08％,β-转角占2.89％;预测SUT1蛋白主要在运载结合中发挥重要作用.SUT1基因表达分析结果表明,SUT1基因在各组织中均有表达,叶中表达量最高,其次分别为叶鞘、茎和根,穗中表达量最低.SUT1基因的克隆及其结构、性质与功能的初步分析,可为研究该基因在甜高粱源库互作关系中的功能机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜吉到	黑龙江八一农垦大学农学院	95	901	18.0	24.0
2	殷奎德	黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院	85	484	11.0	15.0
3	戴凌燕	黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院	57	364	12.0	14.0
4	李明	黑龙江八一农垦大学农学院	8	40	4.0	6.0
5	唐呈瑞	黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院	4	20	2.0	4.0
6	符楠	黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院	3	17	2.0	3.0