湿地松左旋β－蒎烯合成酶基因PeTPS－（－）BPin的同源克隆及生物信息学分析

• 作者: 张露 易敏 潘显强 赖猛 赵衡 雷蕾 黄少伟
• 来源期刊: 江西农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 湿地松 萜烯合成酶 同源克隆 β-蒎烯
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 林业科学
• 页码范围: 205-211
• 页数: 7页
• 分类号: Q785|S791.246.02
• 字数: 4283字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13836/j.jjau.2015031

摘要

通过火炬松等松属树种的cDNA序列同源克隆了湿地松的左旋β－蒎烯合成酶基因（ PeTPS－（－） BPin），分析表明该基因与其他松属植物之间的同源性在90％以上，与松科其他属植物之间的同源性在80％以上。裸子植物不同萜烯合成酶基因（ TPS）之间的同源性在70％以上。被子植物与裸子植物的TPS基因亲缘关系较远。左旋β－蒎烯合成酶的蛋白质分子式为C3197H4972N862O957S32，分子量为71．74 ku，带弱正电，为不稳定蛋白，易分解，含37个磷酸化位点，定位在叶绿体。蛋白质二级结构含有4个不规则卷曲，24个α－螺旋，三级结构中含有一个cd00684保守域。 ELM中找到7个可能的功能域，包括一个NDR切割位点、两个磷酸肽配体、一个PDZ配体、一个SH2配体、两个磷酸化位点。在68、69位存在一个RR保守结构，猜测能够在第二个R的N末端断裂并与底物结合，从而参与底物异构化。在380～384位出现了DDxxD保守域，但未能在该区搜到可能的功能位点。预测的两个磷酸化位点位于302、623位氨基酸。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄少伟	华南农业大学林学院	68	597	12.0	23.0
3	张露	江西农业大学林学院	83	1023	18.0	28.0
4	雷蕾	江西农业大学林学院	6	28	4.0	5.0
5	潘显强	江西农业大学林学院	4	16	2.0	4.0
11	赵衡	江西农业大学林学院	3	10	2.0	3.0
12	易敏	江西农业大学林学院	7	19	2.0	4.0
13	赖猛		5	3	1.0	1.0