大豆再生相关基因GmLEC的克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘佳慧 刘明 姜成涛 孙晶 张希瑞 张超 李思楠 李文滨 李沫 武小霞 王敏 王智 苏安玉 陈庆山 马彦龙
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 再生 GmLEC 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-9
• 页数: 9页
• 分类号: S816.17
• 字数: 4301字
• 语种: 中文

摘要

利用同源克隆技术，对拟南芥再生相关基因LEC进行同源序列比对，从大豆中克隆LEC基因两个成员的全长CDS序列，得到大豆再生相关基因GmLEC1-a，GmLEC1-b及GmLEC2-a，GmLEC2-b，用生物信息学方法对大豆GmLEC1及GmLEC2基因核苷酸序列以及蛋白质结构、亲水性和疏水性及进化树等进行分析。结果表明，大豆再生相关基因GmLEC1-a编码区长度为672 bp，编码223个氨基酸，GmLEC1-b编码区长度为681 bp，编码226个氨基酸，GmLEC2-a编码区长度为2205 bp，编码734个氨基酸，GmLEC2-b编码区长度为2196 bp，编码731个氨基酸，GmLEC蛋白为亲水性不稳定蛋白；通过对LEC蛋白功能结构域进行分析发现，GmLEC1为H4超家族成员，GmLEC2为B3超家族成员，并均与拟南芥属植物亲缘较近。