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广西马流感病毒(A/Equine/Guangxi/1/09)NA基因的克隆与序列分析
广西马流感病毒(A/Equine/Guangxi/1/09)NA基因的克隆与序列分析
作者:
何奇松
冯淑萍
熊毅
胡丽萍
韦建华
颜健华
原文服务方:
南方农业学报
马流感病毒
NA基因
克隆
序列分析
摘要:
[目的]了解广西马流感病毒(Equine influenza virus,EIV)的分子流行病学特征并揭示其遗传变化规律,为其疫苗候选毒株的筛选及有效防控马流感疫情奠定基础.[方法]采用RT-PCR对广西EIV分离株(A/Equine/Guangxi/1/09,简称GX09株)进行NA基因扩增,经克隆测序及序列比对分析,绘制遗传进化树.[结果]GX09株NA基因全长1420 bp,其开放阅读框(ORF)为1413 bp,编码470个氨基酸,包含7个糖基化位点及17个半胱氨酸(Cys)残基.GX09株与参考毒株的NA基因核苷酸同源性为74.7%~99.5%,其推导氨基酸同源性为80.4%~99.4%;与Gansu08株、Heilongjiang08株、Inner mongolia08株及Liaoning08株的核苷酸及其推导氨基酸同源性最高,分别为99.5%和99.4%;与1989年在我国吉林分离获得毒株(Jilin89)的同源性最低,对应的核苷酸及其推导氨基酸同源性分别为74.7%和80.4%.从遗传进化树可以看出,GX09株与最近几年国内外分离获得的毒株亲缘关系较近,且同属于美洲型分支.[结论]目前广西流行的EIV与国内外的流行毒株一致.
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篇名
广西马流感病毒(A/Equine/Guangxi/1/09)NA基因的克隆与序列分析
来源期刊
南方农业学报
学科
关键词
马流感病毒
NA基因
克隆
序列分析
年,卷(期)
2015,(5)
所属期刊栏目
畜牧·兽医·水产·蚕桑
研究方向
页码范围
895-899
页数
5页
分类号
S858.21
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j:issn.2095-1191.2015.5.895
五维指标
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NA基因
克隆
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南方农业学报
主办单位:
广西壮族自治区农业科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-1191
CN:
45-1381/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1964-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7029
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