不同样本前处理方法对高通量测序检测HBV、HCV、TTV结果的影响

• 作者: 史套兴 安小平 王伟 童贻刚 裴广倩 陈禹保
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 多重置换扩增 随机锚定PCR 高通量测序
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 236-240
• 页数: 5页
• 分类号: Q78
• 字数: 3373字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2015.02.019

摘要

目的：探索不同样品前处理方法对于不同类型病毒检测的效果。方法：分别将携带乙肝病毒（双链环状DNA病毒）、丙肝病毒（单正链RNA病毒）、TTV（Torque teno virus）（单链环状DNA病毒）的血清等比例混合，模拟混合感染，然后分别采用多重置换扩增（MDA）和随机锚定PCR扩增并进行高通量测序，同时以原始样品（未扩增）直接高通量测序作为对照。结果：原始样品（未扩增）直接测序，产出的数据大部分为人类的序列；MDA方法中绝大部分数据为TTV、乙肝病毒；随机锚定PCR扩增方法中绝大部分数据为乙肝病毒。结论：MDA方法适合扩增环状病毒，随机锚定PCR扩增适合含量高的病毒，不做任何处理直接高通量测序检测病毒效果最差。本研究可为指导不同类型病原体如何选择扩增方案提供借鉴。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王伟		111	555	12.0	18.0
3	史套兴		8	104	5.0	8.0
7	陈禹保		14	50	3.0	6.0
8	裴广倩	军事医学科学院微生物流行病研究所	6	9	1.0	3.0
9	安小平	军事医学科学院微生物流行病研究所	12	40	3.0	6.0