溶藻弧菌外膜蛋白OmpU的原核表达、抗原性鉴定与生物信息学分析

• 作者: 刘祥
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 溶藻弧菌 OmpU蛋白 细胞表位 蛋白结构 预测
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 页码范围: 37-43
• 页数: 7页
• 分类号: S942|Q78
• 字数: 4515字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2015.06.006

摘要

对溶藻弧菌外膜蛋白OmpU进行分子克隆构建,抗原性生物信息学分析,为疫苗的开发奠定了基础.通过分子克隆获得OmpU蛋白的原核表达菌株,重组表达后利用切胶纯化获得OmpU蛋白,免疫小鼠制备抗血清,WesternBlotting检测发现OmpU蛋白具有很好的抗原性.采用在线软件预测OmpU为亲水的分泌型蛋白;存在多个酶切位点.采用TMHMM Server v.2.0程序预测OmpU无跨膜结构并定位于细胞膜外.通过SignalP 4.1软件分析发现OmpU的1～21位氨基酸为信号肽序列.SOPMA服务器预测OmpU的二级结构含无规则卷曲27.94％,α-螺旋为33.24％,β-转角为10.29％,β-片层为28.53％.采用Swiss Model程序预测三维结构显示OmpU具有3个孔道结构.综合利用ABCpred和BepiPred方案,预测OmpU存在8个B细胞表位.运用神经网络法预测OmpU具有3个CTL表位.使用MHC-Ⅱ类分子结合肽在线程序预测OmpU存在1个Th表位.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘祥	陕西理工学院生物科学与工程学院	22	92	6.0	8.0