桑青枯雷尔氏菌 gsp G和gsp K基因的获取与生物信息学分析

• 作者: 孔卫青 禚苏
• 来源期刊: 山东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 桑树 青枯雷尔氏菌 Ⅱ型分泌系统 gsp基因
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种? 种质资源? 分子遗传学
• 页码范围: 9-12
• 页数: 4页
• 分类号: S432.4+2
• 字数: 2815字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14083/j.issn.1001-4942.2015.03.003

摘要

gsp G和gsp K参与青枯雷尔氏菌Ⅱ型分泌系统周质复合体的形成。本研究以桑青枯雷尔氏菌MR111为材料，利用PCR扩增和DNA测序技术成功获得其gsp G和gsp K基因438 bp和843 bp的序列，在线BLAST分析两个基因编码蛋白与其它青枯雷尔氏菌同源区域的相似性在90％以上。在线CDD分析两个蛋白除分别含有典型的T2SG和T2SK以及N端主要由亮氨酸和丙氨酸组成的分泌型信号肽外，gsp G还含Ⅳ型分泌系统的“Ⅳ＿pilin＿GFxxxE”结构，而在gsp K中则出现了重复的“GIQSTE”序列，该序列在雷尔氏菌属中高度保守。